1　《中国中医基础医学杂志》文稿应当具有科学性、创新性，论点明确，文字精炼，层次清楚，数据准确，书写工整且规范，对研究性论文要求统计学处理。一般文稿字数3，000字以内；综述类文稿不超过5，000字。来稿一律用A4纸打印。

2　专家论坛稿件，要求作者必须是国家级有突出贡献的专家、博士生导师、硕士生导师，具有副高级职称以及在某些新兴领域有创见的中青年专家。并且是结合自己的研究领域，提出的有创新见解的文章。

3　《中国中医基础医学杂志》理论探讨稿件，要求针对本刊的发表特点，针对本刊鼓励发表的优先研究领域，所提出的有创新见解的文章。

4　方法论稿件，要求是针对某一学科、每一专业方向的专业研究方法文章。

5　实验研究论文稿件，要求以各级各类科研基金论文为主，重点是能用新的实验方法去创新、证明中医理论，或探讨中西医均未认识的实验论文。

6　临床基础稿件，要求是临床基础方面的论文，包括某疾病中医病因学调查，证候的临床调研，符合科研设计的临床基础研究和特殊病例的临床分析等。

7　无论何种原因，若作者要求撤稿，请第一作者以书面形式通知编辑部。

8 此外本刊另设有方药研究、中医多学科研究、临证验案等栏目。